Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPOP42166 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPOP42166 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms