Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGFBR1P36897 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms