Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms