Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJC1P36383 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms