Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP7BP35670 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7BP35670 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms