Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC4P35249 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC4P35249 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC4P35249 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC4P35249 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC4P35249 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RFC4P35249 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFC4P35249 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC4P35249 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC4P35249 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms