Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG3P32926 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG3P32926 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG3P32926 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG3P32926 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG3P32926 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG3P32926 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG3P32926 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG3P32926 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms