Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD10P28358 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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