Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms