Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4AP27815 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4AP27815 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms