Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA3P25788 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA3P25788 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms