Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCHP24723 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms