Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF4P23510 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms