Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALB2P22676 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CALB2P22676 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALB2P22676 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms