Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB3BP20337 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB3BP20337 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms