Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCLP19338 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCLP19338 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCLP19338 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCLP19338 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCLP19338 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCLP19338 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms