Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB3P16520 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB3P16520 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB3P16520 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms