Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-DOBP13765 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms