Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG2P13521 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG2P13521 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG2P13521 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms