Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL4P13236 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL4P13236 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL4P13236 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL4P13236 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL4P13236 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL4P13236 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL4P13236 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL4P13236 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL4P13236 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL4P13236 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms