Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms