Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms