Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODC1P11926 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODC1P11926 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODC1P11926 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms