Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
TOP2AP11388 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOP2AP11388 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms