Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms