Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms