Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP1P09874 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP1P09874 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP1P09874 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP1P09874 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARP1P09874 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP1P09874 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP1P09874 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms