Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEFMP07197 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFMP07197 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms