Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNA4P05014 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA4P05014 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms