Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL2A1P02458 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms