Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNTO95613 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNTO95613 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNTO95613 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNTO95613 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNTO95613 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNTO95613 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNTO95613 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNTO95613 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNTO95613 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNTO95613 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNTO95613 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNTO95613 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNTO95613 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNTO95613 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNTO95613 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNTO95613 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNTO95613 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNTO95613 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNTO95613 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNTO95613 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms