Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD4O95243 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD4O95243 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD4O95243 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD4O95243 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD4O95243 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD4O95243 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD4O95243 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD4O95243 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD4O95243 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms