Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIAO1O76071 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CIAO1O76071 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIAO1O76071 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIAO1O76071 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms