Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN2BO60939 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms