Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ABCC9O60706 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms