Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB3O43889 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB3O43889 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CREB3O43889 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CREB3O43889 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms