Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNQ3O43525 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms