Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms