Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTIFO43310 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTIFO43310 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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