Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBDO15205 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBDO15205 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBDO15205 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBDO15205 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBDO15205 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBDO15205 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBDO15205 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBDO15205 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBDO15205 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms