Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IKBKBO14920 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms