Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms