Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms