Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PATL2C9JE40 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms