Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HNRNPCL3B7ZW38 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HNRNPCL3B7ZW38 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms