Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-2B6SEH9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms