Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH2D7A6NKC9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms