Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms