Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRGMA1A4Y4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms