Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WWV3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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